MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 50757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013124	GCGCG	2	10	39438	39447	0 %	0 %	60 %	40 %	256370862
1002	NC_013124	CCA	2	6	39472	39477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370862
1003	NC_013124	TCG	2	6	39498	39503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1004	NC_013124	GC	3	6	39536	39541	0 %	0 %	50 %	50 %	256370862
1005	NC_013124	TCG	2	6	39549	39554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1006	NC_013124	CACCG	2	10	39656	39665	20 %	0 %	20 %	60 %	256370862
1007	NC_013124	GC	3	6	39686	39691	0 %	0 %	50 %	50 %	256370862
1008	NC_013124	AGCG	3	12	39694	39705	25 %	0 %	50 %	25 %	256370862
1009	NC_013124	GCC	2	6	39792	39797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370862
1010	NC_013124	ACG	2	6	39804	39809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1011	NC_013124	CCG	2	6	39826	39831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370862
1012	NC_013124	CG	3	6	39842	39847	0 %	0 %	50 %	50 %	256370862
1013	NC_013124	CGT	2	6	39956	39961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370863
1014	NC_013124	CG	5	10	39972	39981	0 %	0 %	50 %	50 %	256370863
1015	NC_013124	GGT	2	6	39987	39992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370863
1016	NC_013124	CCA	2	6	40000	40005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370863
1017	NC_013124	GC	3	6	40040	40045	0 %	0 %	50 %	50 %	256370863
1018	NC_013124	AGA	2	6	40070	40075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370863
1019	NC_013124	GT	3	6	40077	40082	0 %	50 %	50 %	0 %	256370863
1020	NC_013124	GCG	2	6	40107	40112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370863
1021	NC_013124	GT	3	6	40140	40145	0 %	50 %	50 %	0 %	256370863
1022	NC_013124	TG	4	8	40148	40155	0 %	50 %	50 %	0 %	256370863
1023	NC_013124	TGCGT	2	10	40163	40172	0 %	40 %	40 %	20 %	256370863
1024	NC_013124	GTC	2	6	40218	40223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370863
1025	NC_013124	TCG	2	6	40234	40239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370863
1026	NC_013124	AGG	2	6	40240	40245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370863
1027	NC_013124	GTCT	2	8	40287	40294	0 %	50 %	25 %	25 %	256370863
1028	NC_013124	ACG	2	6	40529	40534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1029	NC_013124	GC	3	6	40543	40548	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1030	NC_013124	CGA	2	6	40554	40559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1031	NC_013124	TCG	2	6	40580	40585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1032	NC_013124	CAC	2	6	40654	40659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370864
1033	NC_013124	GCG	2	6	40663	40668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370864
1034	NC_013124	GCG	2	6	40671	40676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370864
1035	NC_013124	TCG	3	9	40694	40702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1036	NC_013124	ACC	2	6	40724	40729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370864
1037	NC_013124	GCC	2	6	40753	40758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370864
1038	NC_013124	GC	3	6	40770	40775	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1039	NC_013124	GC	3	6	40778	40783	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1040	NC_013124	G	6	6	40800	40805	0 %	0 %	100 %	0 %	256370864
1041	NC_013124	GC	4	8	40839	40846	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1042	NC_013124	C	6	6	40877	40882	0 %	0 %	0 %	100 %	256370864
1043	NC_013124	GTC	2	6	40909	40914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1044	NC_013124	TCG	2	6	40928	40933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1045	NC_013124	ATCGGT	2	12	41056	41067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256370864
1046	NC_013124	CGC	2	6	41190	41195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370864
1047	NC_013124	CGAG	2	8	41291	41298	25 %	0 %	50 %	25 %	256370864
1048	NC_013124	CGT	2	6	41302	41307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1049	NC_013124	GC	3	6	41312	41317	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1050	NC_013124	CGA	2	6	41414	41419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1051	NC_013124	CGC	2	6	41432	41437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370865
1052	NC_013124	GGT	2	6	41442	41447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370865
1053	NC_013124	GGT	2	6	41453	41458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370865
1054	NC_013124	GA	3	6	41505	41510	50 %	0 %	50 %	0 %	256370865
1055	NC_013124	CGA	2	6	41534	41539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1056	NC_013124	TCG	2	6	41590	41595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1057	NC_013124	CGA	2	6	41603	41608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1058	NC_013124	GTC	2	6	41611	41616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1059	NC_013124	AGG	2	6	41635	41640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370865
1060	NC_013124	CGA	2	6	41688	41693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1061	NC_013124	CG	3	6	41718	41723	0 %	0 %	50 %	50 %	256370865
1062	NC_013124	ACG	2	6	41779	41784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1063	NC_013124	CGA	2	6	41956	41961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1064	NC_013124	GAT	2	6	42003	42008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370865
1065	NC_013124	AGC	2	6	42031	42036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1066	NC_013124	TCA	2	6	42098	42103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370865
1067	NC_013124	GAC	2	6	42120	42125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1068	NC_013124	CGC	2	6	42154	42159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370865
1069	NC_013124	GC	4	8	42158	42165	0 %	0 %	50 %	50 %	256370865
1070	NC_013124	GTC	2	6	42195	42200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1071	NC_013124	CGG	2	6	42233	42238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370865
1072	NC_013124	CGTT	2	8	42262	42269	0 %	50 %	25 %	25 %	256370865
1073	NC_013124	CGGAG	2	10	42278	42287	20 %	0 %	60 %	20 %	256370865
1074	NC_013124	CG	3	6	42302	42307	0 %	0 %	50 %	50 %	256370865
1075	NC_013124	GCGAC	2	10	42311	42320	20 %	0 %	40 %	40 %	256370865
1076	NC_013124	CGAG	2	8	42353	42360	25 %	0 %	50 %	25 %	256370865
1077	NC_013124	CAG	2	6	42363	42368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
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1079	NC_013124	CGA	2	6	42449	42454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
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1081	NC_013124	TCGA	2	8	42464	42471	25 %	25 %	25 %	25 %	256370865
1082	NC_013124	AGC	2	6	42484	42489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1083	NC_013124	TCG	2	6	42535	42540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1084	NC_013124	GCT	2	6	42560	42565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1085	NC_013124	CG	3	6	42622	42627	0 %	0 %	50 %	50 %	256370865
1086	NC_013124	AGC	2	6	42658	42663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1087	NC_013124	GC	3	6	42662	42667	0 %	0 %	50 %	50 %	256370865
1088	NC_013124	CCT	2	6	42692	42697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370865
1089	NC_013124	CGG	2	6	42770	42775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370865
1090	NC_013124	ACC	2	6	42822	42827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370865
1091	NC_013124	CCT	2	6	42833	42838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370865
1092	NC_013124	TCG	2	6	42859	42864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1093	NC_013124	GTC	2	6	42951	42956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1094	NC_013124	CGA	2	6	42962	42967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1095	NC_013124	CAG	2	6	42999	43004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1096	NC_013124	GAG	2	6	43014	43019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370865
1097	NC_013124	CTC	2	6	43023	43028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370865
1098	NC_013124	TGT	2	6	43037	43042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256370865
1099	NC_013124	GCG	2	6	43043	43048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370865
1100	NC_013124	ACG	2	6	43160	43165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370866
1101	NC_013124	CG	3	6	43246	43251	0 %	0 %	50 %	50 %	256370866
1102	NC_013124	CGG	2	6	43260	43265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370866
1103	NC_013124	CTC	2	6	43291	43296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370866
1104	NC_013124	GGCCTC	2	12	43348	43359	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256370866
1105	NC_013124	CGCTCG	2	12	43364	43375	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256370866
1106	NC_013124	TCGC	2	8	43392	43399	0 %	25 %	25 %	50 %	256370866
1107	NC_013124	TGG	2	6	43412	43417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370866
1108	NC_013124	GGC	2	6	43432	43437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370866
1109	NC_013124	CG	4	8	43526	43533	0 %	0 %	50 %	50 %	256370866
1110	NC_013124	AGG	2	6	43535	43540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370866
1111	NC_013124	TCC	2	6	43555	43560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370867
1112	NC_013124	GCT	2	6	43564	43569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370867
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1114	NC_013124	CGGT	2	8	43597	43604	0 %	25 %	50 %	25 %	256370867
1115	NC_013124	GCG	2	6	43665	43670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370867
1116	NC_013124	TCGG	2	8	43674	43681	0 %	25 %	50 %	25 %	256370867
1117	NC_013124	CGGA	2	8	43686	43693	25 %	0 %	50 %	25 %	256370867
1118	NC_013124	GCA	2	6	43703	43708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370867
1119	NC_013124	CG	3	6	43718	43723	0 %	0 %	50 %	50 %	256370867
1120	NC_013124	CCG	2	6	43779	43784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370867
1121	NC_013124	GCTC	2	8	43798	43805	0 %	25 %	25 %	50 %	256370867
1122	NC_013124	ACG	2	6	43815	43820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370867
1123	NC_013124	TGC	2	6	43858	43863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370867
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1125	NC_013124	CGCTTG	2	12	43924	43935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370867
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1250	NC_013124	CCG	2	6	48786	48791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370875
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1253	NC_013124	CGA	2	6	48859	48864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370875
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1364	NC_013124	GC	3	6	57418	57423	0 %	0 %	50 %	50 %	256370883
1365	NC_013124	CACGC	2	10	57433	57442	20 %	0 %	20 %	60 %	256370883
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1370	NC_013124	AG	3	6	57523	57528	50 %	0 %	50 %	0 %	256370883
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1372	NC_013124	ACG	2	6	58159	58164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370884
1373	NC_013124	TGCG	2	8	58170	58177	0 %	25 %	50 %	25 %	256370884
1374	NC_013124	ACC	2	6	58178	58183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370884
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1496	NC_013124	TCC	2	6	63965	63970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370890
1497	NC_013124	CGC	2	6	64003	64008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370890
1498	NC_013124	TGA	2	6	64020	64025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370890
1499	NC_013124	GTG	2	6	64051	64056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370890
1500	NC_013124	CGA	3	9	64059	64067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370890

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